development of a PCR-RFLP test system for the identification of mitochondrial lines of the Pelophylax ridibundus lake frog in Kazakhstan 

Дания Ардаковна Уалиева, младший научный сотрудник лаборатории орнитологии и герпетологии, Институт зоологии (Казахстан, г. Алматы, проспект аль-Фараби, 93), E-mail: daniya.2010@mail.ru
Александр Юрьевич Иванов, кандидат биологических наук, преподаватель СПО кафедры зоологии и экологии, Пензенский государственный университет (Россия, г. Пенза, ул. Красная, 40), E-mail: akella58@mail.ru
Олег Александрович Ермаков, кандидат биологических наук, доцент, доцент кафедры зоологии и экологии, Пензенский государственный университет (Россия, г. Пенза, ул. Красная, 40), E-mail: oaermakov@list.ru 

Актуальность и цели. Молекулярное типирование методом ПЦР-ПДРФ позволяет определить видовую принадлежность организмов, имеющих слабые фено-типические различия. Главное преимущество данного метода – это возможность анализировать значительные по объему выборки без применения методов секвенирования. Авторами была поставлена задача разработать тест-систему для идентификации озерных лягушек комплекса Pelophylax ridibundus в Казахстане. Материалы и методы. Анализ был основан на изменчивости первичной структуры митохондриального гена – второй субъединицы НАДН-дегидрогеназы, который является видоспецифичным маркером. В дальнейшем был проведен поиск маркерных нуклеотидных замен, специфичных для каждой линии, и сайтов узнавания для эндонуклеаз рестрикции HaeIII и TasI. Результаты. В результате проведенных исследований было подтверждено обитание трех форм озерной лягушки на территории Казахстана, две из которых – нативные (Балхаш, Сырдарья) и инвазивной анатолийской формы – P. cf. bedriagae. Выводы. Разработанная авторами методика ПЦР-ПДРФ анализа представляет собой простой и надежный инструмент для выявления митохондриальных линий у озерных лягушек комплекса Pelophylax ridibundus и может успешно использоваться в массовых скрининговых исследованиях. 

Ключевые слова

рестрикционный анализ, НАДН-дегидрогеназа, митохондриальная ДНК, Pelophylax ridibundus комплекс 

 Скачать статью в формате PDF

Для цитирования:

Ualiyeva D.А., Ivanov A.Yu., Ermakov О.А. A development of a PCR-RFLP test system for the identification of mitochondrial lines of the Pelophylax ridibundus lake frog in Kazakhstan // Известия высших учебных заведений. Поволжский регион. Естественные науки. 2022. № 1. С. 76–84. doi:10.21685/2307-9150-2022-1-7